青海發光桿菌抗原分型：多殺性巴氏桿菌分為A、B、D、E和F五個莢膜血清型，此外C型為貓和犬的正常棲居群。產毒素多殺性巴氏桿菌為A型和D型。早期的研究將特定的莢膜型與特定的宿主疾病及地理位置在一起，但隨著研究的深入，這種模式越來越不可靠。 B型菌株通常引起亞洲牛和水牛出血性敗血癥，E型菌株只在非洲患出血性敗血癥牛分離到，但近年研究發現，無論在非洲還是世界其他地區，E型菌株都很少分離到。
現在非洲牛流行的出血性敗血癥也以B型為主。禽類主要以A型為主，但在火雞上分離到F型。B、D型也在家禽上分離到，但不致病或癥狀輕微。引起豬進行性萎縮性鼻炎的主要是產毒素的D型，引起豬肺疫的主要是A型，引起牛出血性敗血癥主要為B型。
菌體抗原分型：用凝集反應對多殺性巴氏桿菌的菌體抗原(O抗原)分類，可分為12個血清型，但該分型方法經常會出現交叉反應和自家凝集，沒能廣泛應用。
熱浸出菌體抗原分型：青海發光桿菌用瓊脂擴散試驗對熱浸出菌體抗原分類，可將多殺性巴氏桿菌分為16個（1-16）血清型。豬多殺性巴氏桿菌分離株以1型、2, 5型為主。美國和加拿大等主要來源于火雞禽霍亂的血清型為1型、3型、4型，國內禽多殺性巴氏桿菌分離株以1型為主，其次還有1, 3型、1, 14型、3, 4型、14型等。
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